ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی ارقام بهاره و پائیزه کلزا (Brassica napus L.) با استفاده از نشانگر مولکولی SSR

Authors

  • خادمی, میترا دانشگاه لرستان
  • موسوی, الهام دانشگاه لرستان
  • نظریان فیروزآبادی, فرهاد دانشگاه لرستان
  • کریم بیگی, هادی دانشگاه لرستان
Abstract:

کلزا ).L napus Brassica ،)گیاهی روغنی و زراعی متعلق به خانوادهی شببو است. این خانواده دارای حدوداً 350 جنس و بیش از 3000 گونه است. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی 21 رقم کلزا با استفاده از نشانگرهای مولکولی، از 11جفت آغازگر اختصاصی ریزماهوارهی SSR استفاده شد. آغازگرها در مجموع 76 باند واضح تولید نمودند که 46 باند از آنها چند شکل )5/60 درصد( بودند. میانگین تعداد باندهای تکثیری به ازای هر جفت آغازگر و ژنوتیپ به ترتیب 9/6 و 6/3 بود. هر جفت آغازگر به طور متوسط 2/4 باند چند شکل تولید نمود. در بین آغازگرها، بیشترین تعداد باند تکثیری مربوط به آغازگرهای Na10A09 وCB10036B با 10 باند و کمترین تعداد باند مربوط به آغازگر CB10403 با 4 باند بود. تجزیه خوشهای به روش UPGMA و با استفاده از ماتریس تشابه دایس، ژنوتیپهای کلزا را به 3 گروه اصلی تقسیم نمود. رقم Licord به تنهایی یک گروه را تشکیل داد، درحالی که از لحاظ خصوصیات مرفولوژیکی با بیشتر ژنوتیپها شباهت باالیی داشت. این موضوع احتماالً به دلیل تفاوت در سطح پلوئیدی این ژنوتیپ و یا نامگذاری اشتباه آن میباشد. براساس نتایج حاصل از ماتریس تشابه، بیشترین شباهت )99/0 )مربوط به ژنوتیپهای Zarfam و Gerinimo و کمترین تشابه )72/0 )مربوط به ژنوتیپهای 11-KS و Licord بود. نتایج گروهبندی ژنوتیپها نشان داد که ژنوتیپهای ایرانی و خارجی در یک گروه قرار گرفتند. این موضوع احتماالً قرابت و خویشاوندی نزدیک ژنوتیپهای ایرانی و خارجی را نشان میدهد. نتایج حاصل از تجزیهی مولکولی (AMOVA (دادهها نشان داد که میزان تنوع درون گروهی )پائیزه- بهاره( بیشتر از تنوع بین گروهی است به طوری که 97 درصد تنوع مربوط به تنوع درون گروهها بود.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی ارقام بهاره و پائیزه کلزا (brassica napus l.) با استفاده از نشانگر مولکولی ssr

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی 21 رقم کلزا (brassica napus l.) از نشانگر ملکولی ssr استفاده شد.در این مطالعه از یازده جفت آغازگر اختصاصیssr استفاده شد که در مجموع 76 باند واضح تولید نمودند میانگین تعداد باندهای تکثیری به ازای هر جفت آغازگر و ژنوتیپ به ترتیب 9/6 و6/3 بود. از تعداد کل باندها، 46باند چند شکل بودند،که به طور متوسط هر جفت آغازگر2/4 باند چند شکل تولید نمودند. بنابراین درصد باند های چند ش...

بررسی تنوع ژنتیکی کلزا (brassica napus l.) با استفاده از نشانگر های مولکولی ssr و isj

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی 21 رقم کلزا از 20 جفت آغازگر اختصاصی ssr و نیمه تصادفی isj استفاده شد. آغازگرها در مجموع 158 (05/81 درصد) باند چند­شکل (51 باند ssr و 107 باند isj) تولید کردند. متوسط تعداد باند چندشکل برای آغازگرهای isj، ssr و ترکیب آنها به ترتیب 7/10، 1/5 و 9/7 عدد برآورد شد. میزان اطلاعات چندشکلی (pic) از 015/0 در آغازگر اختصاصی o110d08 تا 3420/0 در آغازگر نیمه اختصاصی et15-33 متغی...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی کلزا (Brassica napus L.) با استفاده از نشانگر‌های مولکولی SSR و ISJ

به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی 21 رقم کلزا از 20 جفت آغازگر اختصاصی SSR و نیمه‌تصادفی ISJ استفاده شد. آغازگرها در مجموع 158 (05/81 درصد) باند چند­شکل (51 باند SSR و 107 باند ISJ) تولید کردند. متوسط تعداد باند چندشکل برای آغازگرهای ISJ، SSR و ترکیب آنها به‌ترتیب 7/10، 1/5 و 9/7 عدد برآورد شد. میزان اطلاعات چندشکلی (PIC) از 015/0 در آغازگر اختصاصی O110D08 تا 3420/0 در آغازگر نیمه‌اختصاصی ET15-33 متغی...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی لاین ها و ارقام زمستانه کلزا (Brassica napus L.) با استفاده از نشان‌گرهای مولکولی RAPDو SSR

The eight SSR′s and 15 RAPD′s primers were used to investigate of genetic diversity and relationship between 20 winter rapeseed genotype. Totally 164 bands were detected from Which 154 were polymorphic. The RAPD primers namely Oligo-670 with 16 bands showed the highest number of detected bands. The mount of Nei′s, Shanon and PIC index for Na12-B02, Ni4-B03, OL10-G04, Oligo-543 and Oligo-670 ind...

full text

ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام بهاره و پائیزه کلزا (brassica napus l.) با نشانـگر مولکولی نیمه تصادفی isj

چکیده: برای بررسی تنوع ژنتیکی 21 رقم کلزا (brassica napus l.) از نشانگر نیمه تصادفی isj استفاده شد.در این مطالعه از دو دسته از آغازگر های نیمه تصادفی استفاده شد که مکان هدف آنها بر اساس توالی نواحی برش اتصال اینترون- اگزون (isj) طراحی می شوند. 10 آغازگر نیمه تصادفی در مجموع 116 باند واضح تولید نمودند که از این تعداد، 107 باند (92%) چند شکل بودند. تفاوت معنی داری بین گروه آغازگر های it و et از ...

15 صفحه اول

بررسی تنوع ژنتیکی لاین ها و ارقام زمستانه کلزا (brassica napus l.) با استفاده از نشان گرهای مولکولی rapdو ssr

به­منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی و تعیین ارتباط ژنتیکی بین 20 ژنوتیپ کلزای زمستانه از 15 آغازگر rapd و 8 آغازگر ssr استفاده شد. از 23 آغازگر مورد استفاده 164 باند حاصل شد که 154 باند آن چند شکل بودند. آغازگر oligo-670 از نشان گرrapd با 16 باند بیشترین تعداد باند چند شکل را داشت. بالا بودن معیارهای تنوع ­ژنی نی، شاخص شانون و میزان pic برای آغازگرهای na12-b02، ni4-b03، ol10-g04، oligo-543 و oligo-670...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 3  issue 1

pages  45- 56

publication date 2016-09

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023